กองวิจัยและพัฒนาข้าว ประกอบไปด้วยการรวมกลุ่มในการทำงาน (Cluster) สนับสนุนให้เกิดการทำงานเป็นเครือข่าย (Network) ใน 7 กลุ่มศูนย์วิจัยข้าว ได้แก่ กลุ่มศูนย์ภาคเหนือตอนบน (5 ศูนย์) กลุ่มศูนย์ภาคเหนือตอนล่าง (3 ศูนย์) กลุ่มศูนย์ภาคกลาง (4 ศูนย์) กลุ่มศูนย์ภาคตะวันออก (3 ศูนย์) กลุ่มศูนย์ภาคตะวันออกเฉียงเหนือตอนบน (5 ศูนย์)กลุ่มศูนย์ภาคตะวันออกเฉียงเหนือตอนล่าง(4ศูนย์) และกลุ่มศูนย์วิจัยภาคใต้ (4 ศูนย์) ดังนี้